Ergenekon iddianamesinin basına yansımasıyla birlikte Ergenekon'la ilgili bir çok iddiada ortaya çıkıyor. Bunların en önemlileri ise genelde silahlı eylemler olarak geçiyor.
Her silahlı eylemin altında ise bir isim yazıyor: Veli Küçük.
Veli küçük'e Ergenekon'ın silahlı eylemlerini planlayan kişi olarak kayıtlar altına girdi. Hatta Veli Küçük ile ilgili Ergenekon'un lideri olduğu bile iddia ediliyor.
Veli Küçük'ün azmettirdiği ya da doğrudan planladığı iddia edilen saldırılardan bazıları:
1- Prof. Dr Necip Hablemitoğlu suikasti
2- Danıştay Saldırısı
3- Cumhuriyet Gazetesi'ne el bombalı saldırı
4- Gazi mahallesinde kahve taranması
5- Küçük'le ilgili en büyük iddialardan biri ise Hrant Dink cinayeti.